一、无效合同纠纷法院应当怎样处理

无效合同纠纷法院的处理是：如果在执行阶段协议无效的话，则法院有权继续执行被执行人名下的财产。根据判决书所作出的判决到执行庭申请强制执行，判决确定合同无效的，不履行就可以，没有什么强制执行的意义。如果法院仅判了借款合同无效，债权人是不能申请强制执行的，因为没有实际可以执行的内容，没有涉及财产的内容是无法执行的。正常情况下，债权人起诉要求宣告借款合同无效，应当同时要求返还借款。如果债权人起诉时只要求宣告合同无效，法院在审查立案时应当向债权人释明，要求追加诉讼请求。如果债权人坚持只起诉宣告合同无效，法院也应当受理。在法院只判决借款合同无效后，因为无法执行，债权人只能另行起诉，要求债务人返还借款了。

二、处理合同纠纷的原则

1.坚持以事实为依据、以法律为准绳，法律没规定的，以国家政策或合同条款为准。

2.以双方协商解决为基本办法。纠纷发生后，应及时与对方当事人友好协商，在既维护本企业合法权益，又不侵犯对方合法权益的基础上，互谅互让，达成协议，解决纠纷。

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3.因对方责任引起的纠纷，应坚持原则，保障我方合法权益不受侵犯;因我方责任引起的纠纷，应尊重对方的合法权益，主动承担责任，并尽量采取补救措施，减少我方损失;因双方责任引起的纠纷，应实事求是，分清主次，合情合理解决。

各企业在处理纠纷时，应加强联系，及时通气，积极主动地做好应做的工作，不互相推诿、指责、埋怨，统一意见，统一行动，一致对外。

法律快车提醒您，合同纠纷的产生往往是由于合同一方不切实履行合同义务造成的，我国合同法对此类现象做出了明确的规定，保证合同的有效履行;对于合同纠纷的问题，我们也有处理合同纠纷的原则需要遵守。合同一旦生效，就标志着合同双方权利和义务的形成，双方应切实履行合同履行制度，保证合同顺利履行。

三、合同纠纷处理存在的风险

合同纠纷处理的环节，存在以下几个主要风险：

1.未建立合同纠纷处理的有效机制，纠纷处理不当，导致单位利益受损;

2.未收集充分的对方违约行为的证据，导致单位在纠纷处理过程中处于举证不力的地位;

3.为按照合同约定追究对方的违约责任，可能导致单位应享有的利益受损。

行政事业单位对于发生的合同纠纷，应当明确合同纠纷的处理方式及相关审批权限和处理责任，纠纷处理过程中，未经批准，相关经办人员不能做出实质性的答复或承诺。

如何处理合同纠纷的相关法律依据：

《民法典》第七百零八条出租人应当按照约定将租赁物交付承租人，并在租赁期间保持租赁物符合约定的用途。